RACE服务

APEX-Seq技术实验服务

服务介绍

APEX-Seq实验是一种亚细胞水平转录组空间分布的RNA测序方法,将特异性蛋白融合具有邻近标记功能的工程化酶即过氧化氢酶APEX2,在特异性蛋白与APEX2融合并导入细胞后,外源添加生物素处理,并经H2O2活化,直接在活细胞内利用特异性融合蛋白将APEX定位在指定区域的RNA进行高精度的生物素标记,进一步根据链霉素磁珠结合体系亲和纯化技术将其捕获与分离生物素标记的RNA,结合高通量测序分析从而检测各种亚细胞水平的转录组RNA的空间分布情况;该方法可适用于对细胞核,核仁,核孔,核纤层,细胞质,内质网内膜,内质网外膜,线粒体基质,线粒体外膜等亚细胞区域结构的RNA分布进行全面动态的分析。

 

技术优势

1. 活细胞原位邻近标记+高通量测序,精准解析亚细胞空间转录组RNA的定位;

2. 适用于有膜细胞器和无膜亚细胞结构的转录组RNA分析;

3. 瞬时捕获RNA瞬时定位,动态转运,捕获应激颗粒,翻译复合物等瞬态结构。

 

公司优势

1. 技术技巧长期积累,技术经验丰富

2. 专业的生物信息学分析。

 

客户提供

1. 确定APEX融合特异性蛋白的名称,种属及靶向亚细胞结构

2. 确定细胞的名称,细胞的分组及处理方式

3. 提供冻存管可以复苏的细胞或生长状态良好的活细胞及其培养条件。

 

最后交付

完整的实验报告包括试剂耗材,厂家货号,实验步骤,实验数据及结果分析等。

 

参考文献

Fazal F M, Han S, Sharma S, et al. APEX-seq maps transcriptome-wide subcellular RNA localization in living cells[J]. Nature, 2026


扫描二维码分享到微信

在线咨询
联系电话

15221233440