RACE服务
CUT&Tag技术实验服务
服务介绍
CUT&Tag(Cleavage Under Targets and Tagmentation)是一种基于抗体引导的高分辨率DNA-蛋白互作研究技术;该方法利用ConA磁珠来捕获细胞,通过转录因子等蛋白的特异性抗体引导ProtienA/G-Tn5转座酶对目标染色质区域进行切割,同时在序列两端加上测序接头,通过PCR扩增后形成用于高通量测序的文库,该技术被广泛应用于表观遗传学和基因调控研究。
技术优势
1. 高灵敏度:可使用极少量细胞(甚至单细胞)进行实验;
2. 低背景噪音:无需甲醛交联或超声破碎,信噪比高;
3. 高分辨率:能够精准定位转录因子或组蛋白修饰的结合位点。
公司优势
1. 技术技巧长期积累,技术经验丰富;
2. 专业的生物信息学分析。
客户提供
1. 提供细胞的具体名称、处理方式及分组信息;
2. 提供冻存管保存的可复苏细胞或生长状态良好的活细胞及其培养条件;
3. 提供ChIP级或CUT&Tag级别的抗体。
最后交付
完整的实验报告包括实验数据及生物信息学分析包括测序数据质量评估,与参考基因组比对,peak峰calling,motif分析,peak峰相关基因注释,差异peak分析,相关基因GO,KEGG富集分析等。
参考文献
[1] Kaya-Okur HS, Wu SJ, Codomo CA, Pledger ES, Bryson TD, Henikoff JG, Ahmad K, Henikoff S. CUT&Tag for efficient epigenomic profiling of small samples and single cells. Nat Commun. 2019 Apr 29;10(1):1930. doi: 10.1038/s41467-019-09982-5. PMID: 31036827; PMCID: PMC6488672.
[2]Meers MP, Bryson TD, Henikoff JG, Henikoff S. Improved CUT&Tag chromatin mapping and analysis tools. Nat Protoc. 2023 Feb;18(2):351-372. doi: 10.1038/s41596-022-00760-0. Epub 2022 Dec PMID: 36460876; PMCID: PMC9909523.
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